- Undang-undang No.17 tahun 2003 tentang Keuangan Negara (Tambahan Lembaran Negara RI No.4286);
- Undang-undang No.20 tahun 2003 tentang Sistem Pendidikan Nasional (Tambahan Lembaran Negara RI No.4301);
- Undang-undang No.12 tahun 2012 tentang Pendidikan Tinggi (Tambahan Lembaran Negara RI tahun 2012 No.158, Tambahan Lembaran negara RI No.5336);
- Peraturan Pemerintah No.19 Tahun 2005 tentang Standar Nasional Pendidikan (Tambahan Lembaran Negara RI No.4496);
- Peraturan Pemerintah No.4 Tahun 2014 tentang Penyelenggaraan perguruan Tinggi dan Pengelolaan Perguruan Tinggi (Tambahan Lembaran Negara Republik Indonesia Tahun 2014 Nomor 16, Tambahan Lembaran Negara RI No.5500);
- Peraturan Presiden Republik Indonesia Nomor 25 Tahun 2018 tentang Institut Agama Islam Negeri Fattahul Muluk Papua (Tambahan Lembaran Negara RI Tahun 2018 Nomor 48);
- Peraturan Menteri Keuangan Republik Indonesia No.210/PMK.05/2022 tentang tata cara pembayaran dalam rangka pelaksanaan anggaran pendapatan dan belanja negara;
- Peraturan Menteri Agama RI No.83/PMK.02/2022 tentang Standar Biaya Masuk Tahun Anggaran 2023;
- Peraturan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 31 Tahun 2018 tentang Organisasi dan Tata Kerja IAIN (Berita Negara Republik Indonesia Tahun 2018 No.1743;
- Peraturan Menteri Agama RI No.13 Tahun 2020 tentang Statuta IAIN Fattahul Muluk Papua;
- Keputusan Direktur Jendral Pendidikan Islam No.1510 Tahun 2015 tentang Izin Penyelenggaran Program Studi pada Program Sarjana STAIN Al Fatah Jayapura;
- Rencana Strategis Institut Agama Islam Negeri Fattahul Muluk Papua Tahun 2020-2024;
- Keputusan Rektor Institut Agama Islam Negeri Fattahul Muluk Papua Nomor 452/In.35/Rk/05/2020 tentang Pedoman Pendidikan IAIN Fattahul Muluk Papua Tahun 2020;
- Keputusan Rektor IAIN Fattahul Muluk Papua No.038/In.35/Rk/01/2022 tentang Penetapan Standar Mutu Pendidikan-Sistem Penjamin Mutu Internal IAIN Fattahul Muluk Papua;
- Keputusan Rektor IAIN Fattahul Muluk Papua No.038/In.35/Rk/01/2022 tentang Penetapan Standar Mutu Pengabdian Kepada Masyarakat-Sistem Penjamin Mutu Internal IAIN Fattahul Muluk Papua;
- Petunjuk Teknis Pengelolaan Penelitian Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat (LP2M) IAIN Fattahul Muluk Papua;
- Surat Keputusan Dekan Fakultas Tarbiyah IAIN Fattahul Muluk Papua No.102/In.35/Dk/FT/09/2020 tentang Penetapan Renstra Fakultas Tarbiyah tahun 2021-2025.
